El IES «José Luis Castillo-Puche» colabora activamente en el proyecto «Custodia fluvial para el refuerzo de la conectividad inter-autonómica en el Río Segura» a través de la construcción de refugios para murciélagos. Este proyecto cuenta con el apoyo del Ministerio de Agricultura y Pesca, Alimentación y Medio Ambiente de España a través de la Fundación Biodiversidad y del Ayuntamiento de Murcia a través de un convenio específico.